在产业结构方面，我国的
玉米加工业加工正在由以淀粉、饲料、酒精为主要产品的初加工向以变性淀粉、赖氨酸、化工醇为主要产品的精深加工乃至生化加工转变，所生成的合成纤维和工程塑料等产品被广泛应用于食品、纺织、汽车、电子、医疗等多个领域。科技投入和应用将形成玉米加工业的新支柱。
由于玉米加工业的快速发展，市场竞争日趋激烈，各个玉米加工企业都致力于抢占新技术和产品制高点，以此来完成从传统技术向现代生物技术的转变，使传统落后的工艺技术和产品向现代化的科技和新兴科技产品迈进。目前，所有的玉米深加工企业，在生产主产品的同时，还会生产大量的副产品。能否取消酒精消费税，同时在增值税方面参照饲料行业给予减免；二是粮食收购主体的确定问题。
